Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms