Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms