Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTAP49354 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms