Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms