Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms