Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms