Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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