Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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