Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms