Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EDIL3O43854 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms