Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GSC2O15499 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GSC2O15499 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GSC2O15499 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GSC2O15499 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GSC2O15499 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GSC2O15499 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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