Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCF2LO15068 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms