Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms