Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms