Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms