Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms