Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC8A2Q9UPR5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC8A2Q9UPR5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms