Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms