Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms