Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms