Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms