Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms