Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SNX15Q9NRS6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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