Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms