Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms