Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM15Q9C019 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms