Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUS3Q9BZE2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms