Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms