Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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