Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms