Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms