Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms