Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms