Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFAF3Q9BU61 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms