Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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