Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms