Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC01583-202ENST00000558082 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms