Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD9AQ99638 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms