Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT140Q96RY7 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms