Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms