Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms