Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms