Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP13Q92995 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP13Q92995 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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