Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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