Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B5

JMY, Junction-mediating and -regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMYQ8N9B5 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JMYQ8N9B5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms