Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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