Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMC1Q7Z7K0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms