Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms