Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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