Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms